Gilų konfliktą egzistuojant tarp tradicinės ir alternatyviosios medicinos rodo jau tai, kad vieningai net nesutariama, kaip abi kryptis pavadinti. Homeopatai kategoriškai nesutinka, kad cheminius medikamentus pacientams siūlantys gydytojai būtų jiems priešpastatomi kaip „profesionalai“, nes gydytojo homeopato licencijai gauti taip pat reikalingas profesionalus medicininis išsilavinimas. Ginčų yra ir daugiau, ir kur kas gilesnių.